Університет FUNDEPOS створений в Коста-Ріці в результаті трьох історичних освітніх подій в галузі економічних наук. Перший із них - з приходом Національного університету в 1983 р. Зі штаб-квартирою в Сан-Дієго, штат Каліфорнія, США, який запровадив першу в країні професійну магістерську програму з ділового адміністрування.
Другий історичний момент настав у 1993 році, коли ця програма була передана, з точки зору її адміністрування, Університету Коста-Ріки (UCR). З цією метою було створено Фонд аспірантури та досліджень в галузі економічних наук (FUNDEPOS).