Магістра в галузі біоінформатики для обчислювальної геноміки

Ступінь магістра ("Laurea Magistrale") в "Біоінформатиці для обчислювальної геноміки " є спільною ініціативою Університету Мілана та Міланського Politecnico di Milano , і буде активована починаючи з навчального року 2019-2020.

Загалом, він має на меті сформувати "вчених-геномних даних" , тобто випускників, які матимуть адекватні знання про молекулярні основи біологічних систем; структуру і функцію біологічних молекул і те, як вони беруть участь у клітинних процесах; технології та платформи для аналізу геномів; інструменти для біоінформатики та геномного аналізу; статистичні та обчислювальні методики для аналізу біомолекулярних даних.

Прийом відкритий для всіх студентів, які мають ступінь бакалавра ("Laurea Triennale") або з біології або біотехнології або аналогічних інформаційних технологій, техніки, математики або фізики.

Відвідавши курси, які викладаються в BCG, ви дізнаєтеся про:

1. Організація інформації в геномі та молекулярно-клітинні процеси в основі експресії генів та її регуляції.
2. Експериментальні методи, що використовуються для вивчення генів та їх функції у різних модельних видів, як прокаріотичних, так і еукаріотичних.
3. Технології, що використовуються в сучасних геномних та епігеномних дослідженнях, такі як аналізи на основі секвенування наступного покоління (секвенування геному та екзома, секвенування РНК, ChIP-Seq тощо).
4. Методи та протоколи біоінформаційного аналізу у дослідженнях функціональної геноміки (секвенування геному та екзома, секвенування РНК, ChIP-Seq тощо).
5. Алгоритмічний, математичний та статистичний підходи, що лежать в основі інструментів біоінформатики та геномного аналізу.
6. Технології баз даних для зберігання та організації даних.
7. Методи моделювання та аналізу, що застосовуються в системній біології для вивчення взаємодій у складних біологічних системах.

Програма включає, як основний крок у формуванні студентів, стажування в дослідницьких лабораторіях або в Міланському університеті, Політехнічному університеті або в інших італійських або зарубіжних дослідницьких інститутах. Дослідницький досвід стажування та його результати будуть описані в підсумковій письмовій дисертації, яка буде обговорюватися перед дисертаційним комітетом.

Місія та цілі

Спільна ступінь магістра з «Біоінформатики для обчислювальної геноміки» (BCG) Politecnico di Milano університету та Politecnico di Milano університету Делі має на меті надати своїм випускникам належні знання про молекулярну основу біологічних систем; будову та функції біологічних молекул та те, як вони беруть участь у клітинних процесах; технології та платформи для аналізу геномів; інструменти для біоінформатики та геномного аналізу; а також статистичні та обчислювальні методології для аналізу біомолекулярних даних.

Таким чином, ступінь BCG включає в себе діяльність, що забезпечує глибокі знання про:

• Організація інформації в геномі та молекулярно-клітинні процеси в основі експресії генів та її регуляції.
• Експериментальні методи, що використовуються для вивчення генів та їх функції у різних модельних видів, як прокаріотичних, так і еукаріотичних.
• Технології, що використовуються в сучасних геномних дослідженнях.
• Методи та протоколи біоінформаційного аналізу у дослідженнях функціональної геноміки.
• Алгоритмічний, математичний та статистичний підходи, що лежать в основі біоінформатики та інструментів геномного аналізу.
• Технології баз даних для зберігання та організації даних.
• Методи моделювання та аналізу, що застосовуються в системній біології для вивчення взаємодій у складних біологічних системах.

Суб'єкти

Університет Деглі Студі ді Мілано запропонує курси, присвячені біологічним темам, тоді як Politecnico di Milano запропонує обчислювальні курси.

1 рік

1 семестр

• Обов'язкові курси: органічна хімія; Біоінформатика та обчислювальна біологія
• Курси за вибором: Генетика, Клітинна та Молекулярна біологія; Біохімія; Програмування та бази даних; Статистика

2 семестр

• Обов'язкові курси: геноміка та транскриптоміка; Наукове програмування; Машинне навчання; Біостатистика

2-й рік

1 семестр

• Обов'язкові курси: просунута геноміка та епігеноміка; Структурна хімія; Системна біологія та мережевий аналіз
• Курси за вибором: міждисциплінарний проект; Геномне управління великими даними та обчислення

Карєрні можливості

Ступінь магістра BCG має на меті підготовку "вчених з питань даних", висококваліфікованих фахівців, здатних об'єднати глибокі знання про молекулярні основи наук про життя з сучасними знаннями сучасних методів та технологій біоінформатики та геномного аналізу. Особливий акцент буде зроблений на кількісних та обчислювальних аспектах наступних, які будуть зосереджені на аналізі, моделюванні та осмисленні біологічних систем. Кінцевою метою є підготовка в мультидисциплінарному контексті професіоналів, готових впоратися з проблемами, що виникають внаслідок сучасних біомолекулярних наук у постгеномну епоху, і здатних об'єднати та інтегрувати знання з біології, генетики, інформатики, інформаційної інженерії та статистика в різних галузях фундаментальних або прикладних досліджень.

Випускники BCG таким чином зможуть:

• Візьміть участь у розробці та проведенні масштабних геномних аналізів.
• Визначте та витягніть біологічне значення з отриманих результатів.
• Проектувати засоби та протоколи для біоінформаційного аналізу різних типів експериментальних даних автономно.
• Відіграйте ключову роль у дослідницьких групах, орієнтованих на базові або прикладні геномні дослідження.
• Координувати та контролювати науково-дослідні проекти та групи, орієнтовані на біоінформатику та геноміку.

Вхід

Обов’язковою умовою доступу до магістерської програми BCG є ступінь бакалавра ("Трієнале Лауреа"), що забезпечує адекватні знання або (1) генетики, молекулярної біології та біохімії, або (2) інформатики, інформаційної техніки та математики. Також необхідне знання англійської мови, як зазначено нижче. Студенти, які досі не закінчили ступінь бакалавра, можуть подати заявку, якщо планують закінчити навчання до 31 жовтня 2019 року (див. Нижче).

Для навчального року 2019-2020 років до програми буде допущено до 50 студентів , вибраних на основі їхніх знань та особистого інтерв'ю.

Вимоги до прийому

Вимоги до вступу до італійських студентів

Італійські студенти можуть подати заяву на отримання ступеня магістра БЦЖ, якщо вони відповідають одному з наступних двох вимог:

• Вони закінчили програму бакалавра (Трієнале Лауреа) в одному з наступних класів:
  • Біотехнологія (клас L2)
  • Біологія (клас L13)
  • Сільське господарство та харчові науки (клас L26)
  • Фармакологічні науки (клас L29)

і під час навчання вони набули щонайменше 30 КУО в біологічних зонах (SSD BIO) з щонайменше 18 CFU в галузі генетики (BIO / 18), молекулярної біології (BIO / 11) і біохімії (BIO / 10).

АБО

• Вони закінчили програму бакалавра (Трієнале Лауреа) в одному з наступних класів:
  • Інформаційна інженерія (клас L8)
  • Комп’ютерні науки (клас L31)
  • Фізика (клас L30)
  • Математика (клас L35)

і під час навчання вони здобули щонайменше 30 КУО в області комп'ютерних наук, інформаційних технологій, біомедичної інженерії, математики та / або статистики (SSD INF / 01, ING-INF / 05, ING-INF / 06, MAT / 01). -09 та / або SECS-S / 01), з щонайменше 6 CFU з математики (MAT / 01-09) і принаймні 12 CFU в одній або декількох з наступних областей: інформатика (INF / 01), інформація інженерія (ING-INF / 05), біомедична інженерія (ING-INF / 06), статистика (SECS-S / 01).

Такі ж критерії застосовуються до кандидатів, які мають іноземні університетські ступені, які вважаються придатними Радою вчителів, в яких можна чітко визначити дисципліни та кількість кредитів, отриманих для кожної дисципліни. Якщо це неможливо, документи, що засвідчують кар'єру кандидатів, будуть детально розглянуті Радою вчителів для того, щоб оцінити, чи відповідає їхній досвід попереднім вимогам.

Студенти магістрантів можуть подати заявку, але їм доведеться отримати ступінь бакалавра (Трієнале Лауреа) до 31 жовтня 2019 року.

Вимоги до вступу до іноземних студентів

• Студенти, які мають диплом бакалавра в галузі, описаній у попередньому пункті (Вимоги до італійських студентів), де курси, що проходять за необхідними дисциплінами, можуть бути чітко визначені разом із кількістю годин / кредитів на курсах. Якщо це неможливо, документи, що засвідчують кар'єру студентів, перевірятимуться вчителем з метою оцінки відповідності їх попереднього рівня попереднім вимогам.

Вимоги до мови

• Студенти повинні добре володіти англійською мовою, мати рівень В2. Студентам, які вже навчаються в Міланському університеті, які не мають сертифікату B2 або еквівалента, пропонується скласти іспит для підтвердження рівня своєї компетентності та надати підтвердження цього під час співбесіди. У виняткових випадках студентів, які не пройшли тестування на B2, можуть прийняти за умови, що рівень володіння англійською мовою, оцінений під час співбесіди, очевидно хороший.
• Знання італійської мови не потрібно для відвідування. Однак, як того вимагають правила, іноземні студенти повинні продемонструвати, що вони отримали базові знання італійської мови до остаточної дисертації.

Вибір і рейтинг

Студенти, які задовольняють вищезазначені передумови, будуть допущені до співбесіди з членами Навчальної Ради для оцінки їх наукових знань.

Адекватна особиста підготовка кандидатів (в їх основних темах), їх здатність спілкуватися англійською мовою та їх мотивація є вирішальними елементами для вступу. Співбесіда оцінить досвід кандидата у темах, пов’язаних із ступенем бакалавра.

Комітет оцінюватиме кожного заявника за 100-бальною шкалою:

• До 50/100 балів буде присуджено резюме кандидата (тип бакалаврату, оцінювання, подальші курси, додаткові ступені тощо).
• До інтерв'ю буде присуджено до 50/100 балів.

Мінімальний бал, необхідний для вступу - 60/100.

Протягом навчального року 2019-2020 співбесіди для італійських студентів та іноземних студентів, які проживають в Італії, відбуватимуться у Департаменті біологічних наук, Via Celoria 26, 16 липня 2019 року, о 9.30.

Іноземні здобувачі, які не проживають в Італії та здобули ступінь бакалавра за кордоном, можуть вибрати онлайн-співбесіду. На початку співбесіди студенти повинні пред’явити дійсне посвідчення особи або паспорт для посвідчення особи.

Зарахування після вступу

Після опублікування результатів студенти, які займають перші 50 позицій у рейтингу заслуг, повинні завершити свою реєстрацію протягом строку, визначеного в повідомленні про конкурс. Згодом, якщо після початкового терміну перші 50 вільних посад не будуть насичені, зарахування буде можливим для студентів з нижчим рейтингом, якщо вони досягли принаймні 60/100 вступного тесту. Зарахування студентів буде підтверджено лише в тому випадку, якщо вони отримають ступінь бакалавра (Трієнале Лауреа для італійських студентів) до 31 жовтня 2019 року. Студенти інших університетів після закінчення навчання до 31 жовтня 2019 року повинні подати сертифікат про присуджений ступінь в Segreteria Studenti.

Предмети

Università Degli Studi di Milano запропонує курси, присвячені біологічним темам, а Politecnico di Milano – обчислювальні.

1-й рік

1-й семестр

• Обов'язкові курси: Органічна хімія; Біоінформатика та обчислювальна біологія
• Курси за вибором: генетика, клітинна та молекулярна біологія; біохімія; програмування та бази даних; Статистика

2 семестр

• Обов’язкові курси: Геноміка та Транскриптоміка; Наукове програмування; Машинне навчання; Біостатистика

2-й рік

1-й семестр

• Обов'язкові курси: Advanced Genomics and Epigenomics; структурна хімія; Системна біологія та мережевий аналіз
• Курси за вибором: Міждисциплінарний проект; Геномне управління великими даними та обчислення

Рейтинг QS 2023 (червень 2022)

• 1-й в Італії
• 139-й у світі

Відвідавши курси, які викладаються на ступені BCG, ви дізнаєтеся про:

1. Організація інформації в геномі та молекулярно-клітинні процеси в основі експресії генів та її регуляції.
2. Експериментальні методи, використані для вивчення генів та їх функції у різних модельних видів, як прокаріотів, так і еукаріотів.
3. Технології, які використовуються в сучасних геномних та епігеномних дослідженнях, як-от аналізи на основі секвенування наступного покоління (секвенування геному та екзому, секвенування РНК, ChIP-Seq тощо).
4. Методи та протоколи біоінформаційного аналізу у функціонально-геномних дослідженнях (секвенування геному та екзому, секвенування РНК, ChIP-Seq тощо).
5. Алгоритмічний, математичний та статистичний підходи, що лежать в основі інструментів біоінформатики та геномного аналізу.
6. Технології баз даних для зберігання та організації даних.
7. Методи моделювання та аналізу, що використовуються в системній біології для вивчення взаємодій у складних біологічних системах.

Програма включає, як фундаментальний крок у формуванні студентів, стажування в дослідницьких лабораторіях у Міланському університеті, Політехнічному університеті або в інших італійських чи іноземних науково-дослідних інститутах. Дослідницький досвід стажування та його результати будуть описані в остаточній письмовій дисертації, яка буде обговорена перед дипломною комісією.

Ступінь магістра BCG спрямована на підготовку «дослідників даних», висококваліфікованих фахівців, здатних поєднати глибокі знання про молекулярні основи наук про життя з сучасними знаннями про сучасні методики та технології біоінформатики та геномного аналізу. Особливий акцент буде зроблено на кількісних та обчислювальних аспектах пізніших, які будуть зосереджені на аналізі, моделюванні та осмисленні біологічних систем. Кінцева мета полягає в тому, щоб підготувати в мультидисциплінарному контексті фахівців, готових впоратися з проблемами, які випливають із сучасних біомолекулярних наук у постгеномну еру, і здатних поєднати та інтегрувати знання з біології, генетики, інформатики, інформаційної інженерії та статистики в різних галузях фундаментальних або прикладних досліджень.

Таким чином, випускники BCG зможуть:

• Беріть участь у розробці та виконанні великомасштабних геномних аналізів.
• Визначте та витягніть біологічне значення з отриманих результатів.
• Розробка інструментів і протоколів для біоінформаційного аналізу різних типів експериментальних даних автономно.
• Відіграють ключову роль у дослідницьких групах, зосереджених на фундаментальних або прикладних геномних дослідженнях.
• Координує та контролює дослідницькі проекти та групи, зосереджені на біоінформатиці та геноміці.