Магістр біоінформатики та обчислювальної біології

Вимоги до ступеня

Програма магістра в галузі біоінформатики та обчислювальної біології вимагає проходження щонайменше 36 семестрових кредитних годин. Програма пропонує вибір між двома композиціями. Доріжка 1 призначена для студентів із загальним досвідом у галузі науки / техніки, тоді як Доріжка 2 призначена для студентів із сильним досвідом у галузі біології. Для подальшого досвіду обидва треки пропонують на вибір три групи за вибором, а саме: орієнтовані на обчислювальну техніку, орієнтовані на статистику та біологічні групи. Обидва також пропонують можливості для досліджень. Очікується, що студенти виберуть трек та факультативну групу, виходячи зі свого досвіду та інтересів, за погодженням із вищим консультантом програми.

Доріжка 1 (MS)

I. Ядро: 15 семестрових кредитних годин

• BMEN 6374 Гени, білки та клітинна біологія для інженерів
• Теми BIOL 6V00 з біологічних наук (обчислювальна молекулярна еволюція)
• CS 5303 Інформатика I
• МАТЕМАТИКА 5303 Розширене числення та лінійна алгебра
• STAT 5351 Імовірність та статистика I (для факультативної групи 2)
• або STAT 5353 Імовірність та статистика для науки про дані та біоінформатики (для факультативних груп 1 та 3)

II. Групи за вибором (Виберіть одну групу за вибором)

Факультативна група 1 (орієнтована на обчислювальну техніку): 15 семестрових кредитних годин

• CS 5343 Аналіз алгоритму та структури даних1
• МАТЕМАТИКА 6312 Комбінаторика та теорія графів
• МАТЕМАТИКА 6341 Біоінформатика
  • або BIOL 5376 Прикладна біоінформатика
  • МАТЕМАТИКА 6346 Аналіз медичного зображення
  • І одне з наступного:
  • CS 6307 Вступ до управління великими даними та аналітики для спеціалістів, які не належать до CS
  • CS 6314 Мови веб-програмування
  • CS 6360 Дизайн бази даних
  • CS 6375 Машинне навчання

Факультативна група 2 (орієнтована на статистику): 18 семестрових кредитних годин

• СТАТ 5352 Імовірність та статистика II
• STAT 6337 Розширені статистичні методи I
• STAT 6338 Розширені статистичні методи II
• STAT 6340 Статистичне та машинне навчання
• МАТЕМАТИКА 6341 Біоінформатика
  • або BIOL 5376 Прикладна біоінформатика
  • МАТЕМАТИКА 6346 Аналіз медичного зображення

Факультативна група 3 (орієнтована на біологію): 15 семестрових кредитних годин

• МАТЕМАТИКА 6341 Біоінформатика
  • або BIOL 5376 Прикладна біоінформатика
  • МАТЕМАТИКА 6345 Математичні методи в медицині та біології
  • МАТЕМАТИКА 6346 Аналіз медичного зображення
  • І два з наступного:
  • BIOL 5375 Гени до геномів
  • BIOL 5381 Геноміка
  • BIOL 6315 Епігенетика
  • BIOL 6373 Протеоміка
  • BIOL 6385 Обчислювальна біологія
    • або BMEN 6389 Обчислювальна біологія
    • або MATH 6343 Обчислювальна біологія

III. Дослідження або факультатив (и) або їх поєднання

• Факультативна група 1: 6 семестрових кредитних годин
• Факультативна група 2: 3 семестрові кредитні години
• Факультативна група 3: 6 семестрових кредитних годин

Доріжка 2 (MS)

I. Ядро: 14 семестрових кредитних годин

• BIOL 5410 Біохімія
• BIOL 5420 Молекулярна біологія
• STAT 5351 Імовірність та статистика I (для факультативної групи 2)
  • або STAT 5353 Імовірність та статистика для науки про дані та біоінформатики (для факультативних груп 1 та 3)
  • МАТЕМАТИКА 5303 Розширене числення та лінійна алгебра

II. Групи за вибором (Виберіть одну групу за вибором)

Факультативна група 1 (орієнтована на обчислювальну техніку): 18 семестрових кредитних годин

• CS 5303 Інформатика I
• CS 5343 Аналіз алгоритму та структури даних *
• МАТЕМАТИКА 6312 Комбінаторика та теорія графів
• МАТЕМАТИКА 6341 Біоінформатика
  • або BIOL 5376 Прикладна біоінформатика
  • МАТЕМАТИКА 6346 Аналіз медичного зображення
  • І одне з наступного:
  • CS 6307 Вступ до управління великими даними та аналітики для спеціалістів, які не належать до CS
  • CS 6314 Мови веб-програмування
  • CS 6360 Дизайн бази даних
  • CS 6375 Машинне навчання

Факультативна група 2 (орієнтована на статистику): 18 семестрових кредитних годин

• СТАТ 5352 Імовірність та статистика II
• STAT 6337 Розширені статистичні методи I
• STAT 6338 Розширені статистичні методи II
• STAT 6340 Статистичне та машинне навчання
• МАТЕМАТИКА 6341 Біоінформатика
  • або BIOL 5376 Прикладна біоінформатика
  • МАТЕМАТИКА 6346 Аналіз медичного зображення

Факультативна група 3 (орієнтована на біологію): принаймні 18 семестрових кредитних годин

• МАТЕМАТИКА 6341 Біоінформатика
  • або BIOL 5376 Прикладна біоінформатика
  • МАТЕМАТИКА 6346 Аналіз медичного зображення
  • МАТЕМАТИКА 6345 Математичні методи в медицині та біології
  • І два з наступного:
  • BIOL 5375 Гени до геномів
  • BIOL 5381 Геноміка
  • BIOL 6315 Епігенетика
  • BIOL 6373 Протеоміка
  • BIOL 6385 Обчислювальна біологія
    • або BMEN 6389 Обчислювальна біологія
    • або MATH 6343 Обчислювальна біологія
    • Теми BIOL 6V00 з біологічних наук (обчислювальна молекулярна еволюція)
    • Теми про біологічні науки BIOL 6V00 (Вступ до програмування для біологічних наук)

III. Дослідження або факультатив (и) або їх поєднання

• Усі факультативні групи: 4 семестрові кредитні години

Інші вимоги

• Для доктора філософії Необхідний студент кафедри біологічних наук, BIOL 5440 Клітинна біологія та BIOL 5460 Кількісна біологія (або еквівалент). Цю вимогу можна виконати, пройшовши ці курси як "факультативи" в програмі біоінформатики та обчислювальної біології.
• Факультативи повинні бути затверджені вищим консультантом програми.
• Заміни на необхідні курси можуть бути здійснені за умови схвалення вищим консультантом програми та керівником відділу математичних наук.
• Студент може вибрати магістерську дисертацію під керівництвом викладача. Дипломний проект може враховувати від 3 до 6 семестрових кредитних годин факультативів до необхідних 36 годин, відповідно до університетської політики. Дипломна робота повинна бути затверджена завідувачем відділу математичних наук. Після завершення дипломного проекту студент повинен успішно захистити його перед своїм дисертаційним комітетом.

*Студенти, які не навчалися дискретним структурам CS 5333, необхідним для аналізу алгоритмів CS 5343 та структур даних, повинні проконсультуватися зі своїм випускником з математики

Як згадувалося в нещодавній статті в Science.

"Сьогодні перспективи працевлаштування в обчислювальній біології - також відомі як біоінформатика - здаються сильними і, здається, зростають, підкріплені фармацевтичною та біотехнологічною промисловістю, яка прагне скористатися перевагами даних геноміки та відкрити нову еру відкриття ліків".

Крім того, сказав нинішній директор NIH Френсіс Коллінз

«Якби я був студентом старшого або першого курсу, який цікавився біологією, я б якомога швидше мігрував у сферу обчислювальної біології ... Існує величезна кількість високоякісних даних, доступних кожному, хто має навички знайти шматочки правди, які ховаються в цій інформації ».

Очікується, що випускники програми або продовжать докторську програму у відповідній галузі, або працевлаштуються у біофармацевтичній та біотехнологічній галузях, дослідницьких лабораторіях, лікарнях та програмних компаніях.

Відділу наук для визначення відповідності.