Жителі Південного Судану є можливість отримати вищу освіту в будь-якому університеті або професійно-технічне училище. Хоча є нестача обох установ, кілька програм на місці, щоб розширити поточний ландшафт вищої освіти в Південному Судані.

Ступінь магістра можна отримати в тому випадку, якщо у вас вже є закінчена освіта бакалавра. В рамках навчання на програмах магістратури необхідно пройти 12-18 навчальних курсів, які часто закінчуються екзаменаційним випробуванням і/або підготовкою проекту.